Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
TRIM23P36406 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM23P36406 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms