Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CYLC1P35663 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CYLC1P35663 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CYLC1P35663 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms