Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ACTN2P35609 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ACTN2P35609 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms