Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ABCC1P33527 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ABCC1P33527 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms