Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	YGR153W	YGR153W	654 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	TDA10	YGR205W	873 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	ERV29	YGR284C	933 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	CDC8	YJR057W	651 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	IBD2	YNL164C	1056 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	TRM112	YNR046W	408 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	SME1	YOR159C	285 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	CAF20	YOR276W	486 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	CIN2	YPL241C	807 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	MCM16	YPR046W	546 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	snR37	snR37	386 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	HCM1	YCR065W	1695 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	ULS1	YOR191W	4860 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	UBX5	YDR330W	1503 nt		4.05	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	NUP2	YLR335W	2163 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	SSH4	YKL124W	1740 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YAP1	YML007W	1953 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YDR355C	YDR355C	303 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YGR035W-A	YGR035W-A	222 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YKL131W	YKL131W	522 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YLR194C	YLR194C	765 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	SWC7	YLR385C	399 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	PPT2	YPL148C	522 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	SWP82	YFL049W	1872 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	UGA2	YBR006W	1494 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	HMG1	YML075C	3165 nt		4.04	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YMR102C	YMR102C	2505 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	TVP38	YKR088C	1014 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	YAL065C	YAL065C	387 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	POM33	YLL023C	840 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	NDL1	YLR254C	570 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	VPS20	YMR077C	666 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	MOH1	YBL049W	417 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	PMC1	YGL006W	3522 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	AIM14	YGL160W	1713 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	SNF2	YOR290C	5112 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	RSC30	YHR056C	2652 nt		4.03	□□□□□ -1.76
SIP1	P32578	BCK2	YER167W	2556 nt		4.03	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	GMC1	YDR506C	1827 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	ERT1	YBR239C	1590 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	VPS38	YLR360W	1320 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	TSC13	YDL015C	933 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	DOG2	YHR043C	741 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	DOG1	YHR044C	741 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	IKI1	YHR187W	930 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YIL021C-A	YIL021C-A	270 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	REE1	YJL217W	597 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YKL151C	YKL151C	1014 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PIR3	YKL163W	978 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	CDC42	YLR229C	576 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RAS1	YOR101W	930 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YBR053C	YBR053C	1077 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YBR063C	YBR063C	1215 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SYF1	YDR416W	2580 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	NUG1	YER006W	1563 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RVB1	YDR190C	1392 nt		4.02	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	NUP133	YKR082W	3474 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YDR029W	YDR029W	315 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MHR1	YDR296W	681 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RIP1	YEL024W	648 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	SLO1	YER180C-A	258 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YGL242C	YGL242C	546 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YPT35	YHR105W	645 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	DAL2	YIR029W	1032 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	CTK2	YJL006C	972 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YJR012C	YJR012C	624 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	REC102	YLR329W	795 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YPL162C	YPL162C	822 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	CUP9	YPL177C	921 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YAR1	YPL239W	603 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	LOA1	YPR139C	903 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YBR096W	YBR096W	693 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PAH1	YMR165C	2589 nt		4.01	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	PRS5	YOL061W	1491 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RPP1A	YDL081C	321 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	GUK1	YDR454C	564 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YGR064W	YGR064W	369 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	NSG1	YHR133C	876 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	OAR1	YKL055C	837 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MRPL13	YKR006C	795 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	UBI4	YLL039C	1146 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YLR202C	YLR202C	327 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YAR075W	YAR075W	474 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	FAR3	YMR052W	615 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	YPL068C	YPL068C	882 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RPS11B	YBR048W	471 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	IDI1	YPL117C	867 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RRP15	YPR143W	753 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	ARP9	YMR033W	1404 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MCP2	YLR253W	1710 nt		4	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	JEM1	YJL073W	1938 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MSN4	YKL062W	1893 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	TDA6	YPR157W	1404 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	ARP2	YDL029W	1176 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	BIO2	YGR286C	1128 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	ECM34	YHL043W	513 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	GLG2	YJL137C	1143 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	RIB5	YBR256C	717 nt		3.99	□□□□□ -1.77
SIP1	P32578	MET12	YPL023C	1974 nt		3.99	□□□□□ -1.77

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.9 ms