Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GBP1P32455 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GBP1P32455 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP1P32455 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP1P32455 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GBP1P32455 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GBP1P32455 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GBP1P32455 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GBP1P32455 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms