Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SFNP31947 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SFNP31947 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SFNP31947 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFNP31947 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFNP31947 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SFNP31947 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SFNP31947 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SFNP31947 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SFNP31947 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SFNP31947 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms