Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CASQ1P31415 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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CASQ1P31415 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CASQ1P31415 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
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