Protein–RNA interactions for Protein: P31273

HOXC8, Homeobox protein Hox-C8, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC8P31273 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXC8P31273 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXC8P31273 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms