Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CTGFP29279 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CTGFP29279 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CTGFP29279 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CTGFP29279 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CTGFP29279 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CTGFP29279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CTGFP29279 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CTGFP29279 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CTGFP29279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CTGFP29279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CTGFP29279 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms