Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJB2P29033 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJB2P29033 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GJB2P29033 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJB2P29033 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms