Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PTPRMP28827 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PTPRMP28827 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
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