Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
POLD1P28340 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD1P28340 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD1P28340 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLD1P28340 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLD1P28340 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLD1P28340 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLD1P28340 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD1P28340 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD1P28340 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD1P28340 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
POLD1P28340 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLD1P28340 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLD1P28340 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLD1P28340 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLD1P28340 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
POLD1P28340 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
POLD1P28340 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms