Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX2P28328 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX2P28328 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX2P28328 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX2P28328 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PEX2P28328 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PEX2P28328 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PEX2P28328 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PEX2P28328 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX2P28328 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms