Protein–RNA interactions for Protein: P28072

PSMB6, Proteasome subunit beta type-6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB6P28072 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PSMB6P28072 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PSMB6P28072 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms