Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO1P25800 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO1P25800 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMO1P25800 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMO1P25800 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMO1P25800 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
LMO1P25800 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms