Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSMA1P25786 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSMA1P25786 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms