Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCNCP24863 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNCP24863 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCNCP24863 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCNCP24863 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNCP24863 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNCP24863 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNCP24863 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNCP24863 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNCP24863 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNCP24863 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNCP24863 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms