Protein–RNA interactions for Protein: P24385

CCND1, G1/S-specific cyclin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND1P24385 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND1P24385 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND1P24385 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND1P24385 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND1P24385 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCND1P24385 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCND1P24385 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCND1P24385 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCND1P24385 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCND1P24385 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCND1P24385 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCND1P24385 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCND1P24385 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCND1P24385 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCND1P24385 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms