Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTPRZ1P23471 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRZ1P23471 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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