Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA6P23229 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ITGA6P23229 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms