Protein–RNA interactions for Protein: P22894

MMP8, Neutrophil collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP8P22894 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MMP8P22894 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP8P22894 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP8P22894 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP8P22894 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MMP8P22894 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MMP8P22894 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MMP8P22894 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MMP8P22894 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MMP8P22894 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MMP8P22894 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MMP8P22894 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MMP8P22894 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms