Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX1P22670 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX1P22670 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX1P22670 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX1P22670 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RFX1P22670 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
RFX1P22670 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX1P22670 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms