Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NF1P21359 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NF1P21359 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NF1P21359 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NF1P21359 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NF1P21359 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NF1P21359 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NF1P21359 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms