Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NTF3P20783 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTF3P20783 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTF3P20783 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms