Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
BCL3P20749 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BCL3P20749 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BCL3P20749 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
BCL3P20749 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BCL3P20749 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BCL3P20749 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms