Protein–RNA interactions for Protein: P20393

NR1D1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D1P20393 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NR1D1P20393 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NR1D1P20393 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms