Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ERCC3P19447 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ERCC3P19447 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms