Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ZKSCAN1P17029 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZKSCAN1P17029 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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