Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GNB3P16520 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GNB3P16520 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GNB3P16520 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GNB3P16520 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms