Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD44P16070 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD44P16070 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD44P16070 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD44P16070 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD44P16070 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD44P16070 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD44P16070 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD44P16070 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms