Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF4P15884 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TCF4P15884 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF4P15884 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TCF4P15884 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TCF4P15884 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TCF4P15884 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TCF4P15884 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TCF4P15884 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms