Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA3

SNHG28, Putative uncharacterized protein SNHG28, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG28P0DPA3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SNHG28P0DPA3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SNHG28P0DPA3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SNHG28P0DPA3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1525.1 ms