Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM228BP0C875 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM228BP0C875 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms