Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOXF2BP0C7M4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOXF2BP0C7M4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms