Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KLK3P07288 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KLK3P07288 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KLK3P07288 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLK3P07288 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLK3P07288 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLK3P07288 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLK3P07288 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms