Protein–RNA interactions for Protein: P06732

CKM, Creatine kinase M-type, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMP06732 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CKMP06732 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CKMP06732 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CKMP06732 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CKMP06732 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CKMP06732 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CKMP06732 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CKMP06732 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CKMP06732 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CKMP06732 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CKMP06732 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKMP06732 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CKMP06732 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMP06732 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMP06732 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMP06732 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CKMP06732 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms