Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYCNP04198 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYCNP04198 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYCNP04198 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MYCNP04198 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MYCNP04198 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MYCNP04198 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms