Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C1RP00736 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C1RP00736 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C1RP00736 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C1RP00736 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C1RP00736 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1RP00736 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1RP00736 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
C1RP00736 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RP00736 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RP00736 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RP00736 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
C1RP00736 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C1RP00736 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C1RP00736 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
C1RP00736 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms