Protein–RNA interactions for Protein: O95613

PCNT, Pericentrin, humanhuman

Predictions only

Length 3,336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNTO95613 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCNTO95613 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCNTO95613 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCNTO95613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCNTO95613 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCNTO95613 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCNTO95613 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCNTO95613 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms