Protein–RNA interactions for Protein: O95503

CBX6, Chromobox protein homolog 6, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX6O95503 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBX6O95503 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBX6O95503 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBX6O95503 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBX6O95503 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBX6O95503 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CBX6O95503 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CBX6O95503 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CBX6O95503 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CBX6O95503 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms