Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLDN7O95471 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLDN7O95471 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms