Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ATG12O94817 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ATG12O94817 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ATG12O94817 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms