Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM2O94769 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM2O94769 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ECM2O94769 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ECM2O94769 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ECM2O94769 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ECM2O94769 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ECM2O94769 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ECM2O94769 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ECM2O94769 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ECM2O94769 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ECM2O94769 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms