Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
FLOT1O75955 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FLOT1O75955 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms