Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PITX3O75364 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PITX3O75364 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PITX3O75364 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PITX3O75364 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX3O75364 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX3O75364 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX3O75364 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX3O75364 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX3O75364 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX3O75364 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX3O75364 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms