Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDH16O75309 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDH16O75309 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH16O75309 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH16O75309 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDH16O75309 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDH16O75309 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH16O75309 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDH16O75309 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms