Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIA3O75145 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIA3O75145 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms