Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TLR5O60602 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TLR5O60602 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TLR5O60602 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR5O60602 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR5O60602 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TLR5O60602 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR5O60602 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR5O60602 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms