Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
KIAA0556O60303 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC34.68■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
KIAA0556O60303 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
KIAA0556O60303 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms